\documentclass[12pt,fleqn]{report}
\usepackage{stmaryrd}
\usepackage{amssymb,amsmath,amsthm,bm}
\usepackage{indentfirst}
\usepackage[top=30mm, bottom=30mm, left=25mm, right=35mm]{geometry}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{shapes,arrows}
\usepackage{fancyhdr}
\makeindex
\usepackage[linktocpage=true,colorlinks,pagebackref=true,linkcolor=blue,citecolor=magenta]{hyperref}
% لینک‌ها به رنگ سیاه ظاهر خواهند شد که برای پرینت گرفتن، مناسب‌تر است
%\usepackage[pagebackref=false]{hyperref}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\usepackage[extrafootnotefeatures]{xepersian}
\settextfont[Scale=1.25]{B Zar}
%\setiranicfont[Scale=1]{PersianModern-Oblique}
\setiranicfont[Scale=1.25]{B Zar}
% چنانچه می‌خواهید اعداد در فرمول‌ها، انگلیسی باشد، خط زیر را غیرفعال کنید
%\setdigitfont{Yas}
%\setdigitfont[Scale=.85]{Persian Modern}
%\setdigitfont[Scale=1.1]{XB Zar}
%\KashidaOn
%تنظیم فاصله‌ی خطوط و پاراگراف‌ها
\linespread{1.4}
\setlength{\parskip}{1ex plus 0.5ex minus 0.2ex}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% تعریف قلم‌های فارسی و انگلیسی اضافی برای استفاده در بعضی از قسمت‌های متن
\defpersianfont\nastaliq[Scale=2.02]{IranNastaliq}
\defpersianfont\chapternumber[Scale=3.02]{B Zar}
\defpersianfont\titr[Scale=1.02]{B Titr}
\defpersianfont\dav[Scale=2]{B Davat}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%تعریف اعداد لاتین برای زمانی که از اعداد فارسی در متن استفاده می‌کنیم
\def\0{\textrm{\lr{0}}}
\def\1{\textrm{\lr{1}}}
\def\2{\textrm{\lr{2}}}
\def\3{\textrm{\lr{3}}}
\def\4{\textrm{\lr{4}}}
\def\5{\textrm{\lr{5}}}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% براساس نسخه‌های از ۱.۲.۵ به بعد بسته‌ی bidi در توابع زیر باید توجه داشت:
% که l یعنی شروع نوشتار از ابتدای خط یا جعبه،
% و r یعنی شروع نوشتار از انتهای خط یا جعبه، 
% و s یعنی شروع نوشتار از وسط خط یا جعبه.
\newdimen\xleftright
\xleftright=\textwidth
\advance \xleftright by -10.5cm
\newcommand{\leftright}[3]{%
	\noindent
	\makebox[4 cm][r]{#1}
	\makebox[\xleftright][s]{}
	\makebox[5.5 cm][l]{#2}
	\makebox[1 cm][l]{#3}%
}
\newcommand{\leftrightb}[2]{%
	\noindent
	\makebox[4 cm][r]{#1}
	\makebox[\xleftright][s]{}
	\makebox[6.5 cm][l]{#2}%
}
\newcommand{\semanticsa}[2]{%
	\noindent
	\makebox[4.3 cm][r]{#1}
	\makebox[\xleftright][c]{اگر و فقط اگر}
	\makebox[6.2 cm][l]{#2}%
}
\newcommand{\semanticsb}[2]{%
	\noindent
	\makebox[3.5 cm][l]{#1}
	\makebox[\xleftright][c]{اگر و فقط اگر}
	\makebox[7 cm][r]{#2}%
}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
% دستورهایی برای سفارشی کردن سربرگ صفحات
\csname@twosidetrue\endcsname
\pagestyle{fancy}
\fancyhf{} 
\fancyhead[RE,LO]{\thepage}
\fancyhead[LE]{\small\iranicfamily\leftmark}
\fancyhead[RO]{\small\iranicfamily\rightmark}
\renewcommand{\chaptermark}[1]{%
	\markboth{\thechapter.\ #1}{}}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

\begin{document}
		\pagenumbering{harfi}
	\tableofcontents
\addcontentsline{toc}{chapter}{پیشگفتار}
\chapter*{پیشگفتار}
\markboth{پیشگفتار}{}
\chapter{فصل اول}
\pagenumbering{arabic}
\section{یک چیزی}
رذبلاتببتب 
\cite{1,2,3,4,5}
\chapter{فصل دوم}
لبیایبایبابلا \cite{2}
\chapter{فصل سوم}
لابلایببایبابلا \cite{3}
\appendix
\chapter[پیوست 1]{}
\chapter[پیوست 2]{}
\begin{thebibliography}{99}
	\addcontentsline{toc}{chapter}{کتاب‌‌‌‌نامه}
	\begin{latin}
		%%%%%%%%%%%%%
		\bibitem{1}
		L. Mandel and E.Wolf, Optical Coherence and Quantum Optics
		(Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1995).
	
		\bibitem{2}
		D. E. Chang, A. S. Sorensen, P. R. Hemmer, and M. D. Lukin, "Quantum optics with surface plasmons," 
		Physical Review Letters \textbf{97}, 053002 (2006).
		
		\bibitem{3}
		M.S. Tame, K.R. McEnery, S.K. $\ddot{O}$zdemir, J. Lee, S.A. 
		er, and M.S. Kim, "Quantum plasmonics.", Nature Physics \textbf{9}, 329 (2013).
		
		\bibitem{4}
		L. Novotny and B. Hecht, \textit{Principles of Nano-optics} (Cambridge University Press, Cambridge, 2012).
		
		\bibitem{5}
		L. Mandel and E.Wolf, Optical Coherence and Quantum Optics
		(Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1995).
		
		\bibitem{6}
		L. Mandel and E.Wolf, Optical Coherence and Quantum Optics
		(Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1995).
		
		\bibitem{7}
		L. Mandel and E.Wolf, Optical Coherence and Quantum Optics
		(Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1995).
		
		\bibitem{8}
		L. Mandel and E.Wolf, Optical Coherence and Quantum Optics
		(Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1995).
		
		\bibitem{9}
		L. Mandel and E.Wolf, Optical Coherence and Quantum Optics
		(Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1995).
		
		\bibitem{10}
		L. Mandel and E.Wolf, Optical Coherence and Quantum Optics
		(Cambridge University Press, Cambridge, UK, 1995).
		
	\end{latin}
\end{thebibliography}
\end{document}