\documentclass{report}
\usepackage[framemethod=TikZ]{mdframed}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Niloofar}

\begin{document}
\begin{mdframed}
این یک مثال است
\footnotemark.
این یک مثال است
\footnotemark.
\end{mdframed}
\LTRfootnotetext{Hessian Matrix}
\LTRfootnotetext{Grad Matrix}
\end{document}