\documentclass{report}
\usepackage{amsthm,amssymb,amsmath,mathrsfs}
\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.2]{XB Niloofar}
\begin{document}

این مورد اول \footnote{فارسی}  و این هم مورد دوم \footnote{English}


\end{document}