با سلام
در ابتدای جدول دوم شما دستور \multicolumn{1}{c}{} \\ قرار دارد که یک سطر خالی ایجاد می کند و موجب می شود دو جدول ناهماهنگ باشد. آن را حذف کنید.
اما اگر باز هم این مشکل وجود داشت به نظر من بهتر است دو جدول را به یک جدول تبدیل کرده و برای ایجاد فاصله بین آن از دستور \begin{tabular}{ |c||c|c|c|c|p{3cm}|c||c|c|c|c| } و برای ایجاد خطوط افقی مجزا در دو جدول به جای \hline از \cline{1-4} استفاده کنید.
به عنوان مثال:
\documentclass[final,1p,times,authoryear]{elsarticle}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{amsfonts}
\makeatletter
\newenvironment{tablehere}
{\def\@captype{table}}
{}
\begin{document}
\section{Comparison}
example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text example text
{\tiny
\begin{center}
\begin{tablehere}
\begin{tabular}{ |c||c|c|c|c|p{2cm}|c||c|c|c|c| }
\cline{1-5}\cline{7-11}
Wisepfening & time & memory & redz & poly &&Noon & time & memory & redz & poly \\
\cline{1-5}\cline{7-11}
Alg & 41m-47s & 158.1& 2& 5 && Alg & 2h-7m-40s & 196.4 & 15 & 7 \\
\cline{1-5}\cline{7-11}
Sauer & 2h-46m-9s &712.39 &24 & 6&& Sauer & 8h-5m & 2006.63 & 467 & 7 \\
\cline{1-5}\cline{7-11}
\hline
\end{tabular}
\end{tablehere}
\end{center}
}
\end{document}
خط انتهای جدول برای نشان دادن هماهنگی است.
نتیجه به صورت زیر است:
