سلام
یک راهش این است که محیط قضایا و شبه‌قضایا را به صورت زیر تعریف کنید:
\newtheorem{thmx}{قضیه}
\renewcommand{\thethmx}{\thechapter.\arabic{thmx}}
\newtheorem{thmy}{توجه}\renewcommand{\thethmy}{\thechapter.\arabic{thmy}}
اما راه درست تر برای تعریف دستورات فوق (به پیشنهاد جناب دامن‌افشان در قسمت نظرات) این است که از دستور \@SepMark به‌جای نقطه و به صورت زیر استفاده شود:
\makeatletter
\newtheorem{thmx}{قضیه}
\renewcommand{\thethmx}{\thechapter \@SepMark\arabic{thmx}}
\newtheorem{thmy}{توجه}\renewcommand{\thethmy}{\thechapter\@SepMark\arabic{thmy}}
\makeatother
حسن این روش این است که زمانی که بخواهیم از دستور {جداکننده}\SepMark برای تغییر جداکننده استفاده کنیم تمام جداکنندها با یک دستور و به طور یکسان تغییر می‌کنند. مثلا دستور \SepMark{-} پیش‌فرض نقطه را به خط فاصله (-) تبدیل می‌کند.
یک راه دیگر آن استفاده از امکانات بسته‌ی \usepackage{ntheorem} است.
پس فایل شما به صورت زیر است:
\documentclass{book}
\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.1]{XB Zar}
\setlatintextfont{Arial}
\makeatletter
\newtheorem{thmx}{قضیه}
\renewcommand{\thethmx}{\thechapter \@SepMark\arabic{thmx}}
\newtheorem{thmy}{توجه}\renewcommand{\thethmy}{\thechapter\@SepMark\arabic{thmy}}
\makeatother
\begin{document}
\chapter{یک}
\section{اولی}
\begin{thmx}\normalfont
اگر داشته باشیم
$a^2+b^2=c^2$
آنگاه
$\angle C=90^\circ$
\end{thmx}
\section{دومی}
\begin{thmx}
اگر داشته باشیم
$a^2+b^2=c^2$
آنگاه
$\angle C=90^\circ$
\end{thmx}
\begin{thmx}
اگر داشته باشیم
$a^2+b^2=c^2$
آنگاه
$\angle C=90^\circ$
\end{thmx}
\begin{thmy}
اگر داشته باشیم
$\angle C=90^\circ$
آنگاه
$a^2+b^2=c^2$
\end{thmy}
\begin{thmy}
اگر داشته باشیم
$\angle C=90^\circ$
آنگاه
$a^2+b^2=c^2$
\end{thmy}
\end{document}
و خروجی زیر را با تکلایو 2017 دارید:
موفق باشید.
ویرایش دوم در مورد سوال شما در قسمت نظرات:
دلیل اینه برای article جواب نمی دهد این است که در کلاس مقاله شما فصل ندارید. پس به صورت زیر باید تعریف کنید:
\makeatletter
\newtheorem{thmx}{قضیه}
\renewcommand{\thethmx}{\thesection\@SepMark\arabic{thmx}}
\newtheorem{thmy}{توجه}\renewcommand{\thethmy}{\thesection\@SepMark\arabic{thmy}}
\makeatother
