هیچ مشکلی نباید وجود داشته باشد. سوماترا صرفای یک برنامه برای مشاهده pdf هست. شما از اون هیچ استفادهای برای نگارش نکردهاید بلکه برای مشاهده فایل خروجی استفاده کردهاید. همچنین تکلایو یک پردازنده فایلهای tex هست که این فایلها را خوانده و سپس یک فایل pdf برای شما تولید میکند.
با توجه به این مطالب، پایاننامههای دیگران نیز صرفا فایلهای tex هستند که میتوان آنها را با تکلایو پردازش کرد. اگر شما نمیتوانید آنها را پردازش کنید، حتما مشکل جای دیگری است.
آخرین نکته را هم عرض کنم که تکلایو 2013 خیلی قدیمی است. پیشنهاد میکنم با تکلایو 2014 آنرا جایگزین کنید.