با احترام
من با ادیتور TeXstudio کار میکنم و مواردی که میگم مربوط به اون هستش (البته در ادیتورهای دیگر هم وضع مشابه همین است).
راهکار برای فهمیدن فایل لاتکی که بیش از ۲۰۰۰ خط یا کمتر یا بیشتر کد نویسی یا نوشته داره اینه که شما بیاین تمام مطالب داخل document رو با Ctrl+T کامنت کنید و بعد کامپایل کنید. اگه مشکی در خروجی نبود، در ادامه مثلاً هر ۲۰ خط به ۲۰ خط رو با Ctrl+U از حالت کامنت خارج کنید و هر بار کامپایل کنید. اینکار رو تا جایی ادامه بدهید که مشکل مورد نظر پیدا بشه. اونوقت مشکل تو اون ۲۰ خطی است که شما اونو از حالت کامنت خارج کردید. اینکار رو تا انتها انجام بدید و یکی یکی مشکلتون رو حل کنید.
من اینکار رو برای فایل شما انجام دادم. چون من عکس‌های شما رو نداشتم ابتدا هرجایی که عکسر رو فراخوانی کرده بودید رو با Ctrl+T کامنت کردم. بعد روند بالا رو انجام دادم. مشکل شما در خط‌های ۶۴۵ و ۸۵۷ است.
در خط ۶۴۵ کد رو به صورت زیر ویرایش کردم
\begin{align}
&$A_a^{i}=\left\{
\begin{array}{l}
1 \,\,\,\,if$ if vessel $i$ is assigned in assignment $a$,\\
0\,\,\,\,otherwise.
\end{array} \right.\ \\
& & $B_a^{kt}=\left\{
\begin{array}{l}
1 \,\,\,\,if$ if section $k$ is occupied at time $t$ in assignment $a$,\\
0\,\,\,\,otherwise.
\end{array} \right.\ \\
& & $C_a^{pw}=\left\{
\begin{array}{l}
1 \,\,\,\,if$ if cargo type $w$ is stored at location $p$ in assignment $a$,\\
0\,\,\,\,otherwise.
\end{array} \right.\ \\
& & $D_a^{pt}=\left\{
\begin{array}{l}
1 \,\,\,\,if$ if assignment $p$ is handled at cargo location $p$ at time $t$,\\
0\,\,\,\,otherwise.
\end{array} \right.\ \\
\end{align}
در خط ۸۵۷ شما در کد
\begin{align}
$x_{kjqt=}\left\{
\begin{array}{l}
1 \,\,\,\,if$ if quay crane $q$ is assigned to bay $j$ of vessel $k$ at time $t$\\
0\,\,\,\,otherwise.
\end{array} \right.\\
$f _{kjt=\,}\left\{
\begin{array}{l}
1 \,\,\,\,if$ if bay $j$ of vessel $k$ is fully handled at time $t$\\
0\,\,\,\,otherwise.
\end{array} \right.\\
$r _{kt=\,\,}\left\{
\begin{array}{l}
1 \,\,\,\,if$ if vessel $k$ is fully handled at time $t$\\
0\,\,\,\,otherwise.
\end{array} \right.\\
\end{align}
چند جا از [ به اشتباه استفاده کرده بودی که با حذف اون مشکلتون حل شد.
موفق باشید.
