سلام
این دو تا خط رو اضافه کنین به قبل از \begin{document}
:
\newcommand*{\lettergroup}[1]{}
\renewcommand{\indexspace}{}
مثال:
\documentclass{book}
\usepackage{makeidx}
\makeindex
\usepackage{xepersian}
\settextfont{Yas}
\newcommand*{\lettergroup}[1]{}
\renewcommand{\indexspace}{}
\begin{document}
متن%
\index{متن}\index{نمایه}\index{ویرگول}\index{آب}\index{بهمن}%
\index{تست}\index{نان}\index{باران}\index{\lr{z}}\index{\lr{b}}
\printindex
\end{document}

نکته: دستور index
رو بلافاصله بعد از کلمه بنویسید.
متن%
\index{متن}
یا
متن\index{متن}