سلام
اینم تصحیح‌شده‌ی فایل شما.
اونجاهایی که تغییر کرده، یک خط فاصله انداختم که متوجه تغییر بشین.
\documentclass[12pt,a4paper]{book}
\usepackage{epsfig}
\usepackage{amsmath}
\usepackage[amsthm,thmmarks]{ntheorem}
\usepackage{amssymb}
\usepackage{tabularew}
\usepackage{thmtools}
\usepackage{pst-plot}
%\usepackage[pdftex]{graphicx}
\usepackage{graphicx}
\textwidth 6.80in
\topmargin -0.50in
\oddsidemargin 0in
\evensidemargin 0in
\textheight 9.00in
\renewcommand{\baselinestretch}{1.5}
\usepackage{xepersian}
\newcommand{\threenumi}{\alph{a}}
\newcommand{\threenumii}{\alph{enumii}}
\renewcommand{\thefootnote}{\fnsymbol{footnote}}
\newcommand{\threenumiii}{\alpha{enumiii}}
\newcommand{\threenumiv}{\alph{enumiv}}
\newcommand{\threenumv}{\alph{enumv}}
\theoremsymbol{\ensuremath{\square}}
\newtheorem{theorem}{قضیه}[section]
\theoremstyle{definition}
\theoremsymbol{\ensuremath{\blacksquare}}
\newtheorem{definition}{تعریف}[section]
\theoremsymbol{\ensuremath{\blacktriangle}}
\theoremstyle{theorem}
\newtheorem{theo}[definition]{قضیه}
\newtheorem{lemma}[definition]{لم}
\newtheorem{prop}[definition]{گزاره}
\newtheorem{coro}[definition]{نتیجه}
\newtheorem{remark}[definition]{ملاحظه}
\newtheorem{nok}[definition]{نکته}
\newtheorem{nok-def}[definition]{نکته و تعریف}
\newtheorem{def-nok}[definition]{تعریف و نکته}
\theoremstyle{definition}
\theoremsymbol{\ensuremath{\blacktriangle}}
\newtheorem{ex}[definition]{مثال}
\newtheorem{conj}[definition]{فرضیه}
\renewcommand\proofSymbol{\ensuremath{\blacksquare}}
\newcommand{\bd}{\begin{definition}}
\newcommand{\ed}{\end{definition}}
\settextfont[Scale=1.3]{B Nazanin}
\setlatintextfont[Scale=1.3]{Times New Roman}
\setdigitfont{XB Zar}
\defpersianfont\iranic[Scale=1.4]{XB Zar}
\defpersianfont\NazaninBold[Scale=1.2]{B Nazanin Bold}
\defpersianfont\AbstractBold[Scale=1.2]{B Nazanin Bold}
\begin{document}
تست
\begin{theorem}
متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه. متن قضیه.
\end{theorem}
\begin{definition}
متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف. متن تعریف.
\end{definition}
\begin{ex}
متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال. متن مثال.
\end{ex}
\end{document}
