راه حل دیگه به شکل زیر است. کافی است فقط کد زیر را قبل از فراخوانی زیپرشین استفاده کنید.
\usepackage{etoolbox}
\patchcmd{\chapter}{plain}{empty}{}{}
کد کامل
\documentclass[a4paper,12pt]{report}
\usepackage{ptext}
\usepackage{fancyhdr}
\usepackage{etoolbox}
\patchcmd{\chapter}{plain}{empty}{}{}
\usepackage{xepersian}
\pagestyle{fancy}
\cfoot{}
\lhead{\thepage}
\settextfont{Yas}
\begin{document}
\chapter{مادهی تاریک در کیهان شناسی}
\ptext[1-5]
\chapter{مادهی تاریک در کیهان شناسی}
\ptext[1-5]
\chapter{مادهی تاریک در کیهان شناسی}
\ptext[1-5]
\end{document}