باید بسته زیپرشین را با option با نام extrafootnotefeatures فراخوانی کنین.
\usepackage[extrafootnotefeatures]{xepersian}
بعد میتونین از هر کدوم از دستورهای زیر استفاده کنین.
\normalfootnotes
\twocolumnfootnotes \threecolumnfootnotes \fourcolumnfootnotes
\fivecolumnfootnotes \sixcolumnfootnotes \sevencolumnfootnotes
\eightcolumnfootnotes \ninecolumnfootnotes \tencolumnfootnotes
\RTLcolumnfootnotes \LTRcolumnfootnotes
\paragraphfootnotes
\setLTRparagraphfootnotes \setRTLparagraphfootnotes
راهنمای بسته bidi را میتونین ببینین.
http://mirrors.ctan.org/macros/xetex/latex/bidi/bidi.pdf
