سلام
به صورت زیر باید تعریف کنید:
\theoremstyle{definition}
\newtheorem{definition}{تعریف}[section]
\newtheorem{remark}[definition]{تبصره}
\newtheorem{tav}[definition]{توجّه}
\newtheorem{tam}[definition]{تمرین}
\newtheorem{claim}{ادعا}[section]
\newtheorem{corollary}{نتیجه}[section]
\newtheorem{example}{مثال}[section]
\newtheorem{proposition}{گزاره}[section]
در واقع شما شمارنده‌ای براش معرفی نکرده بودید و خطا می‌داد.
چند نکته در مورد فایلتون عرض می‌کنم:
چند تعریف تکراری وجود داشت که حذفشون کردم.
فصل‌هایتان را با دستور inlude به فایل اصلی پیوست کنید نه با input
بین این دو دستور تفاوتهایی وجود دارد.
مهمترین نفاوت آنها در این است که زمانی که از دستور inlude استفاده می‌کنید فایلی به نام\include{filename} و با پسوند aux در فایل شما ایجاد می‌شود که تمام ویژگی‌های آن فصل در آن قرار می‌گیرند که امکان پردازش فایل را به تنهایی نیز فراهم می‌کنند در صورتی که input این ویژگی را ندارد.
تفاوت دیگر این است که از دستور inlude نمی‌توان در مقدمه‌ی سند بهره گرفت اما در مورد input این ویژگی وجود ندارد.
تفاوتهایی دیگه‌ای هم وجو دارد که مجالش نیست.
از دستور input سعی کنید برای پیوست فایل‌ها مثل command بهره بگیرید و نه فصل‌ها.
پس دستورات شما به صورت زیر می باشند:
\documentclass{book}
\usepackage[top=43mm,bottom=43mm,left=30mm, right=33mm]{geometry}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{multirow}
\usepackage{diagbox}
\usepackage{geometry}
%\geometry{showframe}
%\geometry{verbose,a4paper, tmargin=3cm, bmargin=2.5cm, lmargin=3cm, rmargin=3cm, footskip=1.5cm}
\newcolumntype{Y}{>{\raggedleft\arraybackslash}X}
\newcolumntype{q}{>{\raggedleft\arraybackslash}p}
% برای رسم جدول با متن طولانی
\usepackage{tikz-cd}
\usetikzlibrary{arrows, matrix}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{pbox}
\usepackage{amsthm,amssymb,amsmath, amsfonts}
\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.1]{XB Niloofar}
\defpersianfont\nastaliq[Contextuals=Swash,Scale=2]{IranNastaliq}
% چنانچه می‌خواهید اعداد در فرمول‌ها، انگلیسی باشد، خط زیر را غیرفعال کنید.
\setdigitfont[Scale=1.1]{Yas}
\renewcommand{\abstractname}{}
%\renewcommand{\latinabstract}{}
%%%%%%%%%%%%
\allowdisplaybreaks
%%%%%%%%%%%%%
\renewcommand\proofname{\textbf{برهان}}
%\newtheorem{remarkname}[definition]{تبصره}
%\renewcommand\remarkname{\textbf{تبصره}}
\renewcommand\proofname{\bf برهان}
\newtheorem{rermark}{تبصره}
%\renewcommand\remarkname{ تبصره}
%\newtheorem{rermark}{ تبصره}
%%%%%%%%%
%\newtheorem{theorem}{قضیه}[section]
%\newtheorem{lemma}[theorem]{لم}
%\newtheorem{proposition}[theorem]{گزاره}
%\newtheorem{corollary}[theorem]{نتیجه}
%\newtheorem{remark}[definition]{تبصره}
%\newtheorem{remark}[theorem]{تبصره}
%\newtheorem{remark}[theorem]{{\textbf{تبصره}}}
%\newtheorem{rermark}{تبصره}
%\newtheorem{rermark}[theorem]{تبصره}
% \newtheorem{remark}{تبصره}[definition]
%\newtheorem{definition}[theorem]{تعریف}
%\newtheorem{example}[theorem]{مثال}
%\newtheorem{xca}[theorem]{ملاحظه}
%\newtheorem{remark}[theorem]{تبصره}
%\newtheorem{theorem}{قضیه}[section]
%\newtheorem{lemma}{لم}[section]
%\newtheorem{proposition}{گزاره}[section]
%\newtheorem{corollary}{}[section]
%\theoremstyle{definition}
%\newtheorem{definition}{تعریف}[section]
%\newtheorem{example}{مثال}[section]
%\newtheorem{xca}{Exercise}[section]
%\newtheorem{remark}{نکته}[section]
%\newtheorem{eee}{قرارداد}[section]
%\numberwithin{equation}{section}
%\newtheorem{naz}{نمادگذاری}[section]
%\newtheorem{si}{نتیجه}[section]
%\newtheorem{taz}{تذکر}[section]
\theoremstyle{definition}
\newtheorem{definition}{تعریف}[section]
\newtheorem{remark}[definition]{تبصره}
\newtheorem{tav}[definition]{توجّه}
\newtheorem{tam}[definition]{تمرین}
%\newtheorem{result}{نتیجه}[section]
\newtheorem{claim}{ادعا}[section]
\newtheorem{corollary}{نتیجه}[section]
\newtheorem{example}{مثال}[section]
\newtheorem{proposition}{مثال}[section]
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\newcommand{\bR}{\mathbb{R}}
%\newcommand{\bC}{\mathbb{C}}
\newcommand{\cB}{\mathcal{B}}
\newcommand{\cO}{\mathcal{O}}
\newcommand{\cG}{\mathcal{G}}
\newcommand{\cU}{\mathcal{U}}
\newcommand{\cK}{\mathcal{K}}
\newcommand{\cS}{\mathcal{S}}
\newcommand{\rM}{\mathrm{M}}
\newcommand{\rC}{\mathrm{C}}
\newcommand{\rV}{\mathrm{V}}
\newcommand{\ls}{\mathrm{LSC}_{+}(X)}
\newcommand{\ce}{\mathrm{C}^{*}(X)}
\newcommand{\lsc}{\mathrm{LSC}}
\newcommand{\fB}{\mathfrak{B}}
\newcommand{\fM}{\mathfrak{M}}
\newcommand{\bt}{\begin{theorem}}
\newcommand{\et}{\end{theorem}}
\newcommand{\bl}{\begin{lemma}}
\newcommand{\el}{\end{lemma}}
\newcommand{\bc}{\begin{corollary}}
\newcommand{\ec}{\end{corollary}}
\newcommand{\bpr}{\begin{proposition}}
\newcommand{\epr}{\end{proposition}}
\newcommand{\bp}{\begin{proof}}
\newcommand{\ep}{\end{proof}}
\newcommand{\be}{\begin{example}}
\newcommand{\ee}{\end{example}}
\newcommand{\bd}{\begin{definition}}
\newcommand{\ed}{\end{definition}}
\newcommand{\ba}{\begin{align}}
\newcommand{\ea}{\end{align}}
\newcommand{\bpe}{\begin{Persian}}
\newcommand{\epe}{\end{Persian}}
\newcommand{\br}{\begin{remark}}
\newcommand{\er}{\end{remark}}
\newcommand{\bs}{\begin{result}}
\newcommand{\es}{\end{result}}
\newcommand{\bcl}{\begin{claim}}
\newcommand{\ecl}{\end{claim}}
\newcommand{\no}{\nonumber}
\begin{document}
\baselineskip=.75cm
\pagenumbering{adadi}
\tableofcontents\clearpage
\pagenumbering{arabic}
\clearpage{\pagestyle{empty}\cleardoublepage}
%برای توضیح این دستور به راهنمای بسته‌ی fancyhdr مراجعه شود
\mainmatter
\clearpage{\pagestyle{empty}\cleardoublepage}
\include{1}
\appendix
\baselineskip=.75cm
%\printindex
\end{document}
خروجی شما نیز با تکلایو 2017 به صورت زیر است:
موفق باشید.
