با سلام
من اشکال فایل شما را رفع کردم. اما این نحوه فرمول نویسی درست نیست. چرا در itemize می خواهید برای فرمول ها شماره بگذارید؟! این نحوه نوشتن اصلا درست نیست. در ضمن فایل شما خطا داشت. دقت کنید که حتما تمامی خطاهای فایل خود را مرتفع کنید. برای مثال شما نمی توانید به صورت زیر در Latex بنویسید.
\begin{align*}\item[(2)]
کد اصلاح شده به صورت زیر است.
\documentclass{article}
\usepackage{amsthm,amssymb,amsmath}
\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.1]{XB Niloofar}
\begin{document}
\begin{LTR}
\begin{itemize}
\item[(1)]$\forall a \in S:(a,a) \in \Psi ~ \mbox{و}~ (a,a) \in \theta \Rightarrow (a,a) \in \Psi .\theta$.
\item[(2)]
\begin{align*}
(a,a) \in \Psi .\theta &\ \ \Rightarrow\ \ \exists c \in S:(a,c) \in \Psi ~ \mbox{و}~(c,b) \in \theta\\
&\ \ \Rightarrow\ \ (b,c) \in \theta ~ \mbox{و}~(c,a) \in \Psi\\
&\ \ \Rightarrow\ \ (b,c) \in \theta .\Psi .
\end{align*}
\end{itemize}
\end{LTR}
\end{document}
نکات:
الف) شما باید ابتدا از محیط itemize استفاده کنید. یعنی:
\begin{itemize}
\item
\item
\end{itemize}
ب) در هر قسمت (item) شما می‌توانید متن خود را بنویسید. حالا می‌توانید فرمول و یا هر عبارت دیگری را بنوسید.
ج) من ترجیح می دهم که این طوری بنویسم.
\documentclass{article}
\usepackage{amsthm,amssymb,amsmath}
\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.1]{XB Niloofar}
\begin{document}
\begin{equation}
\forall a \in S:(a,a) \in \Psi ~ \mbox{و}~ (a,a) \in \theta \Rightarrow (a,a) \in \Psi .\theta
\end{equation}
\begin{align}
(a,a) \in \Psi .\theta &\ \ \Rightarrow\ \ \exists c \in S:(a,c) \in \Psi ~ \mbox{و}~(c,b) \in \theta\nonumber\\
&\ \ \Rightarrow\ \ (b,c) \in \theta ~ \mbox{و}~(c,a) \in \Psi\nonumber\\
&\ \ \Rightarrow\ \ (b,c) \in \theta .\Psi .
\end{align}
\end{document}
که خروجی به صورت زیر است.
د) در هر صورت اگر برکار خود اصرار دارید، به صورت زیر عمل کنید.
\begin{LTR}
\begin{itemize}
\item[(1)]$\forall a \in S:(a,a) \in \Psi ~ \mbox{و}~ (a,a) \in \theta \Rightarrow (a,a) \in \Psi .\theta$.
\item[(2)] $(a,a) \in \Psi .\theta \ \ \Rightarrow\ \ \exists c \in S:(a,c) \in \Psi ~ \mbox{و}~(c,b) \in \theta$
\hskip 2.1cm $\Rightarrow(b,c) \in \theta ~ \mbox{و}~(c,a) \in \Psi$
\hskip 2.1cm $ \Rightarrow (b,c) \in \theta .\Psi $
\end{itemize}
\end{LTR}
که خروجی به صورت زیر است.
