با سلام
این به دلیل این است که شما از محیط itemize درست استفاده نکرده اید. کد را باید این طوری بنویسید:
\documentclass{book}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Zar}
\begin{document}
\begin{itemize}
\item
(TEM)ميكروسكوپ الكتروني عبوري
\item
(ED)پراش الكتروني
\item
(HRTEM) ميكروسكوپ الكتروني عبوري با قدرت تفكيك بالا
\item
(STM)ميكوسكوپ تونل زني روبشي
\item
(AFM)ميكروسكوپ نيروي اتمي
\item(SEM)ميكروسكوپ الكتروني روبشي
\end{itemize}
\end{document}
خروجی در این حالت به صورت زیر خواهد بود.
در واقع شما از \item[] باید هنگامی استفاده کنید که می خواهید به جای دایره های توپور در مثال قبل یک شکل دیگر را بگذارید. مثلا من در کدی که در ادامه می آید به جای دایره های توپر از یک علامت * استفاده کردم.
\documentclass{book}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Zar}
\begin{document}
\begin{itemize}
\item[*]
این یک آیتم است.
\item[*]
این یک آیتم است.
\item[*]
این یک آیتم است.
\end{itemize}
\end{document}
خروجی این مثال به صورت زیر است.
نکته: سعی کنید حتما مطالب یاد شده در پیوند LaTeX/List Structures را مطالعه کنید.
