من با کد زیر توانستم خواسته شما را برآورده کنم. همچنین رنگ متفاوتی را برای عنوان فصل اعمال کردم. اینکه این روش درست هست یا روش سادهتری وجود دارد باید سایر دوستان نظر بدهند.
\documentclass{report}
\usepackage{xcolor}
\usepackage{titlesec}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Niloofar}
\defpersianfont\headfont{XB Titre}
\titleformat{\section}%
{\headfont\Huge\color{cyan}}
{\thesection}{1em}{}
\begin{document}
\chapter{بخش اول}
\section{فصل با قلم تغییر یافته}
تغییر قلم عنوان فصل و بخش در \lr{\LaTeX} چگونه است؟
\end{document}