این کد را به قبل از \begin{document} اضافه کنین.
\makeatletter
\def\@makeLTRfnmark{\hbox{\@textsuperscript{\latinfont\@thefnmark}}}
\renewcommand\@makefntext[1]{%
\parindent 1em%
\noindent
\hb@xt@1.8em{\hss\if@RTL\@makefnmark\else\@makeLTRfnmark\fi}#1}
\makeatother
شماره پاورقیهای لاتین در پاورقی انگلیسی و فارسی، فارسی خواهد بود.
