با استفاده از دستور زیر می‌توانید هر بسته‌ای که خواستید به روز کنید. فکر کنم این راه اصولی‌تره.
tlmgr update bidi
فقط یا با کاربر root این دستور را اجرا کنید و یا اگر sudo دارید با sudo انجام دهید.
ویرایش:
برای بروزرسانی خود نرم‌افزار tlmgr باید از گزینه self و برای بروزرسانی کل بسته‌های تکلایو باید از گزینه all استفاده کنید. البته بهترین کار استفاده همزمان این دو گزینه است، چون گاهی اوقات خود tlmgr نیاز به بروزرسانی دارد و تا بروزرسانی نشود نمی‌توان بسته‌ای را بروزرسانی کرد. بنابراین، همانطور که جناب یزدان‌پور فرمودند، باید به این صورت به کار ببرید:
sudo tlmgr update --self --all
