سلام
وقتی دانشگاهتون میگه فاصله خطوط یک سانتیمتر باشه، منظورش فاصله بین خطوط عادی متن هست.
فاصله محیطهای قضیه و ... باید بیشتر از حالت عادی (۱ سانت شما) باشه.
پس نگران این موضوع نباشین.
البته میشه اینا را هم عوض کرد. باید دستور newtheoremstyle با استفاده از بسته amsmath تعریف بشه.
\newtheoremstyle{note}% name
{.5\baselineskip}% Space above
{.5\baselineskip}% Space below
{}% Body font
{}% Indent amount
{\bfseries}% Theorem head font
{.}% Punctuation after theorem head
{.5em}% Space after theorem head
{}% Theorem head spec (can be left empty, meaning ‘normal’ )
در این کد، نصف فاصله خطوط برای فاصله برای قبل و بعد محیطها تعریف شده که میتونین کم و زیاد کنین.
مثلا میتونین .5\baselineskip را حذف و 0.5cm یا هر چی دلتون میخاد بذارین.
بعد باید دستور
\theoremstyle{note}
را قبل از \newtheorem ها باید بذارین.
یعنی بصورت:
\theoremstyle{note}
\newtheorem{theorem}{قضیه}
برای توضیح بیشتر، میتونین راهنمای بسته amsthm را ببینین.