۱- برای مرتبسازی صحیح کلمات فارسی و ظاهر شدن مراجع فارسی قبل از مراجع انگلیسی حتما باید مطابق روشی که در بخش «مرتبسازی مراجع بر اساس نام نویسنده» صفحه ویکی که لینک دادید، ذکر شده است، از bibtex8 استفاده کنید:
bibtex8 -W -c cp1256fa filename
در غیراینصورت اول مراجع لاتین ظاهر میشوند.
۲- درخصوص پرسش دومتان، سبک plain-fa آنگونه عمل نمیکند. باید از سبک unsrt-fa استفاده کنید و در این حالت نیازی به bibtex8 ندارید.