سلام
دلیل این موضوع اینه که شما \ref{} رو داخل $$ قرار دادید. اگر $$ رو بردارید مشکل حل میشه:
\begin{equation}
\label{eq:3.6.r.org}
\Vert x_n - x^{*} \Vert
\end{equation}
به وسیله فرمول بالا یعنی شماره (\ref{eq:3.6.r.org}) ارجاع دهی بر عکس نوشته می شود.
پیروز باشید
