اگر منظورتان این است که شماره مرجع در محل ارجاع انگلیسی باشد به جای cite از Latincite استفاده فرمایید.
و اگر میخواهید شماره قضیه ارجاعی هم لاتین باشد به صورت زیر عمل کنید:
\Latincite[\lr{Theorem 3.1}]{refTag}
مثال زیر را ملاحظه فرمایید:
\documentclass{article}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{Yas}
\begin{document}
وفا خلیقی دستور
\verb+parsiitems+
را بیان کرده است. رجوع کنید به:
\cite[بخش ۳.۱]{Khalighi15xepersian}
یا
\Latincite[Sec 3.1]{Khalighi15xepersian}
یا
\Latincite[\lr{Sec 3.1}]{Khalighi15xepersian}
\setLTRbibitems
\begin{thebibliography}{9}
\resetlatinfont
\bibitem{Khalighi15xepersian}
Vafa Khalighi. The XePersian Package, Persian for \LaTeXe{} over \XeTeX.
http://ctan.org/pkg/xepersian, 2015.
\end{thebibliography}
\end{document}
خروجی آن به صورت زیر است: