با سلام
با توجه به اینکه شما در فضایی کوچک می خواهید از دستورات مربوط به گراف استفاده کنید پیشنهاد می کنم به جای آن از دستور زیر استفاده کنید.
\begin{tikzpicture}
\tikzstyle{every node}=[circle,fill=black,scale=0.35]
\node at (0,0)(a) {};
\node at (0,0.5)(b){};
\draw[thick](a)--(b){};
\end{tikzpicture}
نتیجه به صورت زیر خواهد بود: