همونطور که آقای صفی اقدم گفتند دستور زیر در ابتدای فایل فصل را تعریف نمی کند و چون شما بخش تعریف کرده اید شماره فصل را صفر در نظر می گیرد.
\textbf{\LARGE فصل1 }\\
\vspace{0.5cml}
\large\bf{تعاریف و پیش نیازها}\\
شما باید این دستور رو به شکل زیر تغییر بدید:
\chapter{تعاریف و پیش نیازها}
