سلام
علت ایجاد سه تا صفحۀ خالی اینه که شما با اون دستوری که اشاره کردین، در بدنۀ سندتون طوری استفاده شده که هر دستور انگار از پاراگراف جدید شروع شده و با توجه به ماهیت این دستور، لاتک اون پاراگراف‌ها رو در خروجی لحاظ کرده و اون پاراگراف‌ها با همدیگه سه صفحۀ خالی ایجاد کردن! (اگه دستوراتتون زیاد می‌بودن، صفحات بیشتری هم ایجاد می‌شد و عکس آن نیز صادق است!)
احتمالاً اینطور به‌نظر برسه که اگه اون خطوط خالیِ بین دستورهای فایل dictionary.tex پاک بشن، مشکل حل بشه! بله تاحدودی حل می‌شه ولی همچنان یک صفحه خالی وجود خواهد داشت! چون واژه‌نامه با دستور chapter آغاز می‌شه و بنا به همون دلیلی که پیشتر اشاره شد، لاتک فکر می‌کنه که در فایل dictionary.tex چیزی نوشته شده است و واژه‌نامه را از صفحه جدید شروع خواهد کرد. به همین سادگی :)
برای رفع این مشکل، می‌تونین به این صورت اصلاح کنین و خروجی مطلوب بگیرین:
\documentclass{report}
\input{command}
\input{Glossary}
\glsaddall
\begin{document}
\printglossary
\end{document}
