منظور من از فایل کمینه، فایلی هست که کامل باشه؛ یعنی قابل اجرا باشه. با این حال احتمال میدم شما دارید از بسته tocbibind
استفاده میکنید. این بسته به طور پیشفرض، «نمایه» رو به فهرست مطالب اضافه میکنه. از طرفی شما از دستور
\addcontentsline{toc}{chapter}{نمایه}
هم استفاده کردید که این هم خودش، «نمایه» رو به فهرست مطالب اضافه میکنه. برای جلوگیری از دو بار ظاهر شدن «نمایه» در فهرست مطالب، ۲ راه دارید:
بسته tocbibind
رو به صورت زیر استفاده کنید:
\usepackage[notindex]{tocbibind}
دستور
\addcontentsline{toc}{chapter}{نمایه}
رو حذف کنید.