من یک چیز مشابه با دستورهای بدوی درست کردم. مسلما راه حل‌های بهتر هم وجود دارد اما خواستم راه حل ارائه شده سازگاری با متن فایل اصلی شما داشته باشد.
\documentclass[10pt,twoside,ffancyhe]{book}
\usepackage{fancyhdr}
\usepackage{geometry}
\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.05]{HM XNiloofar}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\renewcommand{\chaptermark}[1]{\markboth{#1}{}}
\fancypagestyle{headings}{\renewcommand{\headrulewidth}{0.5pt}}
\fancyhead[LE,RO]{~~\bfseries\thepage}
\fancyhead[LO]{\bfseries\rightmark}
\fancyhead[RE]{\bfseries\leftmark}
\fancyfoot[RO]{\begin{picture}(0,0)
\put(0,0){\rule{1pt}{1.1\textheight}}
\put(0,0){\rule{\textwidth}{1pt}}\end{picture}}
\fancyfoot[LE]{\begin{picture}(0,0)\put(0,0){\rule{1pt}{1.1\textheight}}\end{picture}}
\fancyfoot[RE]{\begin{picture}(0,0)\put(0,0){\rule{\textwidth}{1pt}}\end{picture}}
\fancyfoot[C]{}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\begin{document}
\pagestyle{headings}
\baselineskip=1cm
\chapter{عنوان فصل}
\section{عنوان بخش}
مشکل من شخصی سازی هدر و همینطور رسم خط عمودی در حاشیه چپ و راست نوشته و یک خط افقی زیر نوشته پایین صفحه به عنوان حاشیه های متن هست.
میخوام هدر به همین صورتی که ملاحظه می‌کنید در صفحات زوج و فرد متفاوت باشه، فقط مشکلم اینه که طول و محل شروع و خاتمه خطی که بالای صفحه رسم شده رو نمیتونم تغییر بدم. در مورد خطوط هم که توضیح دادم.
پیشاپیش ممنون از راهنمایی شما.
\newpage
متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن
\newpage
متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن
متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن
\newpage
متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن متن
\end{document}
