سلام
مشکل شما آن است که با دستور زیر، تعریف تئوری را به صورت فارسی انجام دادهاید.
\newtheorem{theorem}{قضیه}
که به منظور چاپ آن، باید از بسته زیپرشین استفاده کنید که بعد از فراخوانی کلیه بستهها باید با استفاده از دستور زیر فراخوانی گردد.
\usepackage{xepersian}
\settextfont{Yas}
که در آن، Yas فونت مورد استفاده است.
اما در صورتی که نوشتار شما به زبان انگلیسی است و میخواهید قضایای شما انگلیسی باشند (همانگونه که از فایل شما مشخص است)، کافی است خط مربوط به تئوری را به صورت زیر تغییر دهید:
\newtheorem{theorem}{Theorem}
و به طور کلی کلیه تئوریها را به زبان انگلیسی بازنویسی کنید.
برای اطلاع بیشتر از محیط تئوری میتوانید به تئوریها و پاسخ در لاتک مراجعه کنید.