سلام. فایلتون نه کمینه بود نه اجرایی!
اون روشی که شما استفاده کردید برای نوشتن مراجعتون، راهکار کاملا خودکار برای مرتبسازیش وجود نداره (چه به صورت الفبایی چه به شکل ترتیب ارجاعها). یک سری روشها اگر بگردید روی وب پیشنهاد شده که همش اضافه کردن کد لازم داره که ممکنه با خروجی فارسی مدنظر شما سازگار هم نباشه.
اصولا استفاده از این روش ارجاع، راهکار جالبی هم برای ارجاع دادن برای یک پایاننامه با چند صد مرجع نیست. مال وقتی هست که حداکثر ده بیست مرجع وجود داشته باشه و استایل خاصی هم مدنظر نباشه.
بهتره از bibtex استفاده کنید. اینجا رو بخونید.
در این صورت باید مراجعتون رو مجددا وارد کنید.