چون خودتون فاصله گذاشتید. باید به صورت
\documentclass{article}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Zar}
\begin{document}
یکی از مهمترین مسیرهای پایه، حرکت در خط مستقیم\LTRfootnote{cruise}
\end{document}
یا
\documentclass{article}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Zar}
\begin{document}
یکی از مهمترین مسیرهای پایه، حرکت در خط مستقیم%
\LTRfootnote{cruise}
\end{document}
بنویسید.