علت بزرگ شدن حروف انگلیسی وجود گزینهی uppercase در تنظیمات پیشفرض هدر است. برای از بین بردن این حالت کافیه که از بستهی fancyhdr همراه با تنظیمات نمونهی زیر استفاده کنید:
\documentclass{book}
\usepackage{fancyhdr}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{Yas}
\begin{document}
%%%%%%%%%%%%%
\pagestyle{fancy}
\renewcommand{\chaptermark}[1]{\markboth{#1}{}}
\renewcommand{\sectionmark}[1]{\markright{ #1}}
\fancyhf{}
\fancyhead[LO]{\small \bfseries \rightmark \hfill \thepage}
\fancyhead[RE]{\small \bfseries \thepage \hfill \leftmark}
\fancypagestyle{plain}{%
\fancyhead{}
}
\renewcommand{\headrulewidth}{0pt}
%%%%%%%%%%%%%
\chapter{فصل}
\section{\lr{Text} $u_t$}
\newpage
دارم
\newpage
دارم
\end{document}
برای آشنایی بیشتر به راهنمای این بسته مراجعه کنید.
