سلام
فایلتونو گرفتم و تنها کارهایی که کردم که به نتیجه شما برسم اینا بودن.
کافیه خطوط
\pagestyle{fancy}
\fancyhf{}
\cfoot{\thepage}
\fancyhead[RE]{\leftmark}
\fancyhead[LE]{پایاننامۀ کارشناسی ارشد}
\fancyhead[LO]{عنوان پایاننامه}
قبل از
\begin{document}
و خط
\pagestyle{fancy}
را قبل از
\include{chap1}
خط اولتون رو بصورت زیر بنویسین:
\documentclass[a4paper,fleqn,twoside]{report}
خروجی: