سلام
برای اندیسهای چندخطی میتونین از دستور \substack{line1 \\ line2 \\ line3}
استفاده کنین.
\documentclass[12pt]{report}
\usepackage{amsmath,amsfonts}
\usepackage{xepersian}
\settextfont[Scale=1.1]{B Nazanin}
\setdigitfont[Scale=1]{XB Zar}
\setlatintextfont{Times New Roman}
\newtheorem{thm}{قضیه}
\begin{document}
\begin{thm}
فرض کنید
\begin{align*}
\lambda_k(H(A)) &= \min_{w_1, \dotsc, w_{k-1} \in \mathbb{C}^n}
\max_{\substack{x \in \mathbb{C}^n \\ \lVert x\rVert_2 = 1 \\
x \perp w_1, \dotsc, w_{k-1}}}
\frac{x^*H(A)x} {x^*x} \\
& \le \min_{ w_1, \dotsc, w_{k-1} \in \mathbb{C}^n}
\max_{\substack{x \in \mathbb{C}^n \\
\lVert x \rVert_2 = 1\\
x \bot w_1, \dotsc, w_{k-1}}}
\lVert Ax\rVert_2 = \sigma_k(A)
\end{align*}
\end{thm}
\begin{thm}
فرض کنید
\begin{align*}
\lambda_k(H(A)) &= \min_{w_1, \dotsc, w_{k-1} \in \mathbb{C}^n}
&& \max_{\substack{x \in \mathbb{C}^n \\ \lVert x\rVert_2 = 1 \\
x \perp w_1, \dotsc, w_{k-1}}}
&& \frac{x^*H(A)x} {x^*x} \\
& \le \min_{ w_1, \dotsc, w_{k-1} \in \mathbb{C}^n}
&& \max_{\substack{x \in \mathbb{C}^n \\
\lVert x \rVert_2 = 1\\
x \bot w_1, \dotsc, w_{k-1}}}
&& \lVert Ax\rVert_2 = \sigma_k(A)
\end{align*}
\end{thm}
\end{document}
برای نقطهگذاری هم، بهتره از اینا استفاده کنین: