سلام
کد زیر را ملاحظه بفرمایید:
\documentclass{book}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{XB Zar}
\begin{document}
شخصي به نام والاس\footnote{Wallace}اين تئوري را ارائه كرد
\end{document}
البته همانطور که مشخص است نیازی به عدد گذاری توسط شما نیست و به صورت خودکار انجام میشود.
اگر از تک استودیو و یا بیدی تک میکر(که بقیه پیشنهاد نمیکنن هرچند که من خودم بدون کوچکترین مشکلی ازش استفاده میکنم) استفاده کنید این گزینه ها رو برای راحتی کار به صورت مجزا در دسترس شما قرار داده.