اشتباه انجام دادین. دستور subsection هر چی که بعد آکولاد بسته‌ش بیاد، فکر می‌کنه متن بعدشه و میبره اول خط بعد.
باید دستور فوت‌نوت را ٔاخل آکولاد بنویسین.
یعنی:
\subsection{سرایت\LTRfootnote{Contagion}}
برای راحتی خواندن این‌طور می‌نویسم.
\subsection{سرایت%
\LTRfootnote{Contagion}}
نوشتن در دو خط فقط برای قاطی نشدن فارسی با انگلیسی‌ها هست. درصد آخر خط اولی برای فاصله نیافتاده بعد کلمه «سرایت» و قبل شماره فوت‌نوت هست.
ممکنه با نوشتن این دستورها به این صورت خطا بگیرین. اینم بخاطر اینه که مجاز به نوشتن فوت‌نوت در subsection و ... نیستین.
برای حل این مشکل راه‌های مختلفی هست.
۱- استفاده از بسته bidiftnxtra.
دقت کنین باید بعد از بسته xepersian باید فراخوانی بشه.
۲- استفاده از دستور \protect دقیقا قبلا از دستور \footnote
یعنی:
\subsection{سرایت%
\protect\LTRfootnote{Contagion}}
