از آنجایی که متن شما راست به چپ پردازش میشود پس طبیعی است که جدول نیز در این محیط راست به چپ چیده شود و طبیعتا در محیط `latin` همانطوری که خودتان متوجه شده‌اید چپ به راست چیده میشود. راه حل شما استفاده از محیط `LTR` است در واقع این محیط چینش را از چپ به راست انجام می‌دهد لکن قلم را عوض نمی‌کند و همان قلم فارسی می‌ماند اما محیط لاتین قلم را نیز قلم لاتین می‌کند.
\documentclass{report}
\usepackage{graphicx,amsthm,amsmath,amssymb}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{Yas}
\setdigitfont{Yas}
\begin{document}
\begin{LTR}
\begin{tabular}{c c c c}
\hline
$x$ & $max|\phi(x)-\phi_{m,n}(x)|$\\
\cline{2-4}
& $(m,n)=(2,4)$ & $(m,n)=(4,4)$ & $(m,n)=(8,4)$\\
\hline
0.00 & 123\\
\hline
\end{tabular}
\end{LTR}
\end{document}
پی‌نوشت:
۱- از فایلی که ضمیمه کرده‌اید بر می‌آید که نسخه زی‌پرشین و بی‌دی شما خیلی خیلی قدیمی است پس بهتر است که هر چه سریعتر آن را نیز آپدیت کنید.
۲- مطالعه راهنماهای بی‌دی و زی‌پرشین نیز به شما اکیدا توصیه می‌گردد.
