متاسفانه فایل بسیار آشفته‌ای است با اینکه قرار است کمینه باشد!
نمیدانم آیا واقعا این همه بسته‌ای را که لود کرده‌اید، کار دارید؟ خصوصا که برخی بسته‌ها دوباره لود شده‌اند!!
از تمام این‌ها که بگذریم در فایل شما در دو نقطه یکی لود بسته زی‌پرشین و دیگر آن دستور دو ستونی نمودن نویسه علامت چپ به راست درج شده است: Unicode Character 'LEFT-TO-RIGHT MARK' (U+200E)؛ مطمئن نیستم لکن احتمالا به سبب ویرایشگری است که استفاده می‌کنید و همین باعث می‌شود تا این دستورات دیگر شناخته شده نباشند!
بهرحال از آنجایی که امکان ضمیمه نمودن فایل در پاسخ وجود ندارد لذا متن فایلتان را در اینجا کپی می‌کنم و بهتر است که این کد را بجای کد قبلی فایلتان بگذارید.
ضمنا از فایل شما بر می‌آید که زی‌پرشین شما بروز نیست و بهتر است آن را بروزرسانی کنید.
به علاوه مجاز به لود هیچ بسته‌ای پس از بسته زی‌پرشین نمی‌باشید، منظور بسته fncychap است که اتفاقا توسط زی‌پرشین پشتیبانی هم نمی‌شود.
% -------------------- DON'T EDIT ----------------------------------------
\documentclass[a4paper,12pt,twoside,openright]{xepersian-thesis-maragheh}
\usepackage[vmargin=3.5cm,left=3cm,right=4cm]{geometry}
\usepackage{amsmath,amsthm,amssymb,amsfonts}
\usepackage[marginal,stable,bottom]{footmisc}
\usepackage{mathtools}
%\usepackage[all]{xy}
%\usepackage{perpage}
%\MakePerPage{footnote}
\usepackage{cite}
\usepackage{setspace}
\allowdisplaybreaks
\usepackage{parskip}
\usepackage{xecolor}
\usepackage{makeidx}
\usepackage{verbatim}
\usepackage[colorlinks,linkcolor=blue,citecolor=blue]{hyperref}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{ifthen}
%\usepackage{index}
\usepackage{pgf,tikz}
\usetikzlibrary{matrix}
\usetikzlibrary{arrows}
\usepackage{fancyhdr}
\usepackage{indentfirst}
\usepackage{lastpage}
\usepackage{ptext}
\usepackage[extrafootnotefeatures]{xepersian}
\settextfont{Yas}
\twocolumnfootnotes
%\usepackage[Lenny]{fncychap}
\begin{document}
\pagenumbering{harfi}
\newpage
\vspace*{-1cm}
\section*{پیشگفتار}
\addcontentsline{toc}{section}{پیشگفتار}
منطق فازی%
\LTRfootnote{Fuzzy logic}
در سال ۱۹۶۵ توسط پروفسور لطفی‌زاده%
\LTRfootnote{Lotfizadeh}
از دانشگاه کالیفرنیا در برکلی ارائه شد. در سال ۱۹۷۲ میشو سوکینو%
\LTRfootnote{M. Sugeno}
از انستیتو تکنولوژی توکیو نظرات زاده را با ارائه‌ی مفهوم اندازه‌ی فازی و انتگرال فازی تعقیب کرد. سوگینو اندازه‌ی فازی را مانند توابع مجموعه‌ای پیوسته و یکنوا با هدف ارزیابی کردن کمیت غیرجمعی%
\LTRfootnote{Non-additive}
در دستگاه‌های مهندسی معرفی کرد.
اندازه‌های فازی متفاوتی مانند اندازه‌های گمان%
\LTRfootnote{Belief}،
اندازه فازی امکان%
\LTRfootnote{Possibility}
و ... موجودند. به ویژه در شاخه‌های متفاوت ریاضی انواع زیادی از توابع مجموعه‌ای غیرجمعی وجود دارد.
اندازه‌ها و انتگرال‌های فازی می‌توانند برای مدل‌سازی مسائل در محیط‌های غیرقطعی مورد استفاده واقع شوند. انتگرال‌های فازی یا انتگرال‌های سوگینو ویژگی‌های جالب زیادی از نقطه نظر ریاضی دارند.
ویژگی‌‌ها و کاربردهای انتگرال فازی توسط نویسنده‌های زیادی از جمله رالسکو%
\LTRfootnote{Ralesuu}
و آدامز%
\LTRfootnote{Adam}،
رومن-فلورس%
\LTRfootnote{Rom$\acute{a}$n-Flores}،
ونگ%
\LTRfootnote{Wang}
و کلیر%
\LTRfootnote{Klir}،
پاپ%
\LTRfootnote{E. Pap}،
آگاهی%
\LTRfootnote{Aghahi}
و اسلامی%
\LTRfootnote{Eslami}،
کارلسون%
\LTRfootnote{Carlson}
و ... مطالعه شده است.
فصل اول این پروژه، شامل مطالبی از آنالیز کلاسیک و آنالیز فازی است. در فصل دوم و سوم نامساوی هاردی و نامساوی فریتز کارلسون را با ذکر یک مثال بیان می‌کنیم.
\end{document}
ویرایش
با بسته fncychap نیز کامپایل گردید تا متوجه عدم پشتیبانی زی‌پرشین از آن بشوید:
