سلام
برای تنظیمات صفحه مطابق ساختار زیر عمل کنید:
\fancyhead{}
\fancyfoot{}
\fancyhead[R]{\leftmark}
\fancyhead[L]{\thepage}
اما چرا در صفحه درست تنظیم نمی‌شوند به خاطر ترتیب بسته‌ها است. بسته‌ی geometry را در ابتدای سند و مطابق زیر فراخوانی کنید:
\documentclass[a4paper]{book}
\usepackage[top=30mm,bottom=25mm,left=25mm,right=30mm,
includehead=true,includefoot=true]{geometry}
\usepackage{subfigure}
\usepackage{caption}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{calc}
\usepackage{fancyhdr}
\pagestyle{fancy}
\usepackage{bidiftnxtra}
\usepackage{footmisc}
\usepackage{indentfirst}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{xepersian}
\settextfont{Nazli}
\DeclareMathOperator*{\argmin}{\arg\min}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\fancyhead{}
\fancyfoot{}
\fancyhead[R]{\leftmark}
\fancyhead[L]{\thepage}
%\fancyfoot[C]{\thepage}
\renewcommand{\headrulewidth}{2pt}
\renewcommand{\footrulewidth}{2pt}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\begin{document}
\newpage
\pagenumbering{arabic}
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
\chapter{سلام}
این متن شما است.
\newpage
این متن شما است.
\end{document}
خروجی شما با نسخه‌های اولیه‌ی تکلایو 2018 به صورت زیر است:
موفق باشید.
